新生兒患者可以采取物理加中醫的治療方法。這個方法是在中醫的理論下結合現代化治療儀器，共同作用的治療方法，再結合益智康腦丸進一步促進患者恢復，治療時摒棄了西醫的副作用和依賴性，逐漸控制改善當前的病癥。

新生兒腦積水也可以采取手術治療，可選擇腦室-腹腔分流術，但手術后容易并發分流不足、分流過度、分流管梗阻及感染等。

有條件的也可在內鏡下微創手術治療，這個不需要終生帶管。其中，軟性內鏡是一種新的工具，其外徑僅有3.8mm，相當于筷子粗細。由于其柔軟、纖細、靈活的特性，在腦積水的診斷和治療中有其獨特優勢，因為它創傷更小，恢復更快，效果更佳。